本发明公开了一种用大豆蛋白提取菠萝蛋白酶的方法,首先将新鲜菠萝皮或菠萝茎做洗净、榨汁、过滤、离心等处理,获取澄清杂质少的菠萝汁。在快速搅拌菠萝汁的同时,按1︰10~2︰10(V/V)加入浓度为0.5~2%(W/V)的大豆蛋白溶液,将pH调至3~5,使菠萝蛋白酶吸附到大豆蛋白上,产生絮状沉淀,完成菠萝蛋白酶的吸附。通过5000~8000转/分钟离心条件收集絮状沉淀,得到酶膏。最后将酶膏冷冻干燥,获得干燥的菠萝蛋白酶。本发明提取的菠萝蛋白酶具有酶活力高、杂质少的特点,提取工艺简单,生产成本低、回收率高,设备投入少,易于扩大生产规模。