[00364131]伤寒沙门菌基因组DNA芯片的制备与基因表达谱分析应用研究
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技术详细介绍
该研究利用伤寒沙门菌现有的全基因组序列,以Ty2菌株的基因组为基准,选取CT18菌株和z66阳性菌株的特异性的蛋白编码基因,设计特异性引物,经PCR有效扩增出4201基因,产物纯化后点样于多聚赖氨酸玻片制备伤寒沙门菌基因组DNA芯片。通过对基于该芯片的基因表达谱分析技术的各种条件进行优化,建立了较为成熟的伤寒沙门菌基因组DNA芯片及表达谱分析方法,为有关伤寒沙门菌基因表达调控及致病性机理,进化和基因多样性等方面的深入研究提供有效的技术支持。伤寒沙门菌全基因组DNA芯片的应用范围较广,伤寒沙门菌的基因表达谱研究,对开展伤寒沙门菌的致病机理研究,以及作为原核模式生物的研究平台,对认识生物细胞基因表达调节网络研究,具有不可替代的作用。同时,还可用于针对伤寒沙门菌的比较基因组学研究,通过比较不同基因组间的差异性,深入研究差异性的分子机制,并与细菌的表型特征和进化规律联系起来,为该病原生物的朔源,感染疾病的诊断等研究和应用打下坚实基础。
该研究利用伤寒沙门菌现有的全基因组序列,以Ty2菌株的基因组为基准,选取CT18菌株和z66阳性菌株的特异性的蛋白编码基因,设计特异性引物,经PCR有效扩增出4201基因,产物纯化后点样于多聚赖氨酸玻片制备伤寒沙门菌基因组DNA芯片。通过对基于该芯片的基因表达谱分析技术的各种条件进行优化,建立了较为成熟的伤寒沙门菌基因组DNA芯片及表达谱分析方法,为有关伤寒沙门菌基因表达调控及致病性机理,进化和基因多样性等方面的深入研究提供有效的技术支持。伤寒沙门菌全基因组DNA芯片的应用范围较广,伤寒沙门菌的基因表达谱研究,对开展伤寒沙门菌的致病机理研究,以及作为原核模式生物的研究平台,对认识生物细胞基因表达调节网络研究,具有不可替代的作用。同时,还可用于针对伤寒沙门菌的比较基因组学研究,通过比较不同基因组间的差异性,深入研究差异性的分子机制,并与细菌的表型特征和进化规律联系起来,为该病原生物的朔源,感染疾病的诊断等研究和应用打下坚实基础。