X为了获得更好的用户体验,请使用火狐、谷歌、360浏览器极速模式或IE8及以上版本的浏览器
帮助中心 | 关于我们
欢迎来到合肥巢湖经开区网上技术交易平台,请 登录 | 注册
尊敬的 , 欢迎光临!  [会员中心]  [退出登录]
当前位置: 首页 >  科技成果  > 详细页

[01200116]三疣梭子蟹多样性芯片的研发及其在种质鉴定中的应用

交易价格: 面议

所属行业: 其他电子信息

类型: 非专利

交易方式: 资料待完善

联系人:

所在地:

服务承诺
产权明晰
资料保密
对所交付的所有资料进行保密
如实描述
|
收藏
|

技术详细介绍

三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)广泛分布于中国、日本、朝鲜及马来西亚群岛等海域,它具有肉质好、生长快、产量高等优点,经济价值高,养殖利润丰厚,随着海水养殖的快速发展,三疣梭子蟹养殖已成为各沿海地区的主导养殖品种。然而,从上世纪80年代起,因海洋污染和过度捕捞等诸多因素,导致三疣梭子蟹野生种群资源严重衰退,国内各地纷纷开展增殖放流,由此带来的问题是土著种族的基因可能会因此受到严重污染,为保护土著种族的基因资源,保护消费者的权益,三疣梭子蟹的种群鉴别问题已越来越受到有关政府部门的重视。另外,为保护野生种群资源,三疣梭子蟹不同地理种群内自繁和种群间杂交研究工作也已陆续开展。但在大面积推广三疣梭子蟹种内群体间杂交育种之前,亲本溯源问题应该特别引起重视。 DNA指纹图谱技术是分子生物学领域新兴的技术之一,它是从组织中提取纯化的基因组DNA(gDNA),用某种限制性内切酶把DNA切割成为许多不同长度的小片段,再在电泳作用下,将不同长度的DNA片段分开。近年来,基因芯片技术的发展给DNA指纹图谱分析带来了新的思路。多样性芯片技术(Diversity Arrays Technology,DArT)就是这样一种综合基因芯片、AFLP、PCR、分子克隆以及分子杂交技术原理等的一种新遗传标记技术,它具有高通量和低成本的显著特点,较好地克服了以往以跑电泳凝胶为主的标记技术产量低、成本高、耗时长、自动化程度低以及依赖核酸序列信息等缺点,是一种比较理想的遗传标记技术,已成功应用于多种畜牧和农作物的遗传多样性和种质鉴定研究。 本项目拟采用多样性芯片技术,在三疣梭子蟹不同地理种族比较基因组杂交研究基础上,开展芯片DNA指纹图谱分析,在初期研发用的高密度芯片杂交基础上,制备应用性的经济型芯片,探索建立快速、高效、准确的三疣梭子蟹种质鉴定方法。该项目将为我市三疣梭子蟹土著种族的种质鉴定、人工选育提供理论与技术支持,并指导对三疣梭子蟹种质资源的科学管理和保护,指导人工放流,避免遗传多样性下降。并可做为一个技术平台,对其它养殖种类的种质、品系、♀♂等鉴别提供理论与实践。为今后水产品流通领域的水产品种内地理标记的建立奠定理论与技术基础。 本成果首先确定了降低基因组DNA复杂性的方法为Pst I/Taq I组合,这组酶切所对应的多态性效率最高。随后我们采用这种方法构建了三疣梭子蟹5个不同地理种群Pst I/Taq I基因组代表性DNA片段文库,从中获得2500个DArT候选标记点制成多样性芯片。杂交后提取荧光值,计算获得0或1标记矩阵。根据0或1标记矩阵和ANOVA分析结果显示,5个三疣梭子蟹地理种群经多样性芯片分型,初步筛选获得313个DArT标记,多态性效率为12.5%。对313个DArT标记进行了测序,并进行BLAST分析,其中38个序列为已知序列。将筛选获得的上述候选DArT标记重新点制成多态性富集芯片,每个点重复3次。此芯片为低密度芯片。5个三疣梭子蟹地理种群再次与多态性富集芯片杂交。数据分析显示Q>71%,call rate>93.5%,不一致性(discordance)<0.01,符合质量标准。基于上述结果,我们开发了三疣梭子蟹多样性芯片检测试剂盒,试剂盒中包括了DNA提取试剂、获得Pst I/Taq I基因组代表性DNA片段的相关试剂、标记试剂以及杂交试剂。同时还设计了数据处理软件,包括数据基本处理及图谱的判读软件。本成果发表论文1篇,申报专利1项。 宁波市人工养殖三疣梭子蟹已有近30年的历史,近十几年来发展十分迅猛,其养殖规模迅速扩大。目前,宁波市三疣梭子蟹良种场已获批建设。三疣梭子蟹多样性芯片倘若研发成功,在育种领域,它能迅速应用到良种繁育和增殖放流中,不但可以亲本溯源、种质鉴定,而且能结合生产实践中的良种生物学特性,进行优良性状连锁基因的精确定位;在水产品领域,它能用于市售三疣梭子蟹冰鲜品、加工品等来源的鉴别,具有重要的经济和社会意义。
三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)广泛分布于中国、日本、朝鲜及马来西亚群岛等海域,它具有肉质好、生长快、产量高等优点,经济价值高,养殖利润丰厚,随着海水养殖的快速发展,三疣梭子蟹养殖已成为各沿海地区的主导养殖品种。然而,从上世纪80年代起,因海洋污染和过度捕捞等诸多因素,导致三疣梭子蟹野生种群资源严重衰退,国内各地纷纷开展增殖放流,由此带来的问题是土著种族的基因可能会因此受到严重污染,为保护土著种族的基因资源,保护消费者的权益,三疣梭子蟹的种群鉴别问题已越来越受到有关政府部门的重视。另外,为保护野生种群资源,三疣梭子蟹不同地理种群内自繁和种群间杂交研究工作也已陆续开展。但在大面积推广三疣梭子蟹种内群体间杂交育种之前,亲本溯源问题应该特别引起重视。 DNA指纹图谱技术是分子生物学领域新兴的技术之一,它是从组织中提取纯化的基因组DNA(gDNA),用某种限制性内切酶把DNA切割成为许多不同长度的小片段,再在电泳作用下,将不同长度的DNA片段分开。近年来,基因芯片技术的发展给DNA指纹图谱分析带来了新的思路。多样性芯片技术(Diversity Arrays Technology,DArT)就是这样一种综合基因芯片、AFLP、PCR、分子克隆以及分子杂交技术原理等的一种新遗传标记技术,它具有高通量和低成本的显著特点,较好地克服了以往以跑电泳凝胶为主的标记技术产量低、成本高、耗时长、自动化程度低以及依赖核酸序列信息等缺点,是一种比较理想的遗传标记技术,已成功应用于多种畜牧和农作物的遗传多样性和种质鉴定研究。 本项目拟采用多样性芯片技术,在三疣梭子蟹不同地理种族比较基因组杂交研究基础上,开展芯片DNA指纹图谱分析,在初期研发用的高密度芯片杂交基础上,制备应用性的经济型芯片,探索建立快速、高效、准确的三疣梭子蟹种质鉴定方法。该项目将为我市三疣梭子蟹土著种族的种质鉴定、人工选育提供理论与技术支持,并指导对三疣梭子蟹种质资源的科学管理和保护,指导人工放流,避免遗传多样性下降。并可做为一个技术平台,对其它养殖种类的种质、品系、♀♂等鉴别提供理论与实践。为今后水产品流通领域的水产品种内地理标记的建立奠定理论与技术基础。 本成果首先确定了降低基因组DNA复杂性的方法为Pst I/Taq I组合,这组酶切所对应的多态性效率最高。随后我们采用这种方法构建了三疣梭子蟹5个不同地理种群Pst I/Taq I基因组代表性DNA片段文库,从中获得2500个DArT候选标记点制成多样性芯片。杂交后提取荧光值,计算获得0或1标记矩阵。根据0或1标记矩阵和ANOVA分析结果显示,5个三疣梭子蟹地理种群经多样性芯片分型,初步筛选获得313个DArT标记,多态性效率为12.5%。对313个DArT标记进行了测序,并进行BLAST分析,其中38个序列为已知序列。将筛选获得的上述候选DArT标记重新点制成多态性富集芯片,每个点重复3次。此芯片为低密度芯片。5个三疣梭子蟹地理种群再次与多态性富集芯片杂交。数据分析显示Q>71%,call rate>93.5%,不一致性(discordance)<0.01,符合质量标准。基于上述结果,我们开发了三疣梭子蟹多样性芯片检测试剂盒,试剂盒中包括了DNA提取试剂、获得Pst I/Taq I基因组代表性DNA片段的相关试剂、标记试剂以及杂交试剂。同时还设计了数据处理软件,包括数据基本处理及图谱的判读软件。本成果发表论文1篇,申报专利1项。 宁波市人工养殖三疣梭子蟹已有近30年的历史,近十几年来发展十分迅猛,其养殖规模迅速扩大。目前,宁波市三疣梭子蟹良种场已获批建设。三疣梭子蟹多样性芯片倘若研发成功,在育种领域,它能迅速应用到良种繁育和增殖放流中,不但可以亲本溯源、种质鉴定,而且能结合生产实践中的良种生物学特性,进行优良性状连锁基因的精确定位;在水产品领域,它能用于市售三疣梭子蟹冰鲜品、加工品等来源的鉴别,具有重要的经济和社会意义。

推荐服务:

Copyright    ©    2016    合肥巢湖经开区网上技术交易平台    All Rights Reserved

皖ICP备15001458号

运营商:科易网